Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATRQ13535 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
ATRQ13535 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ATRQ13535 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATRQ13535 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATRQ13535 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
ATRQ13535 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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