Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
MSLNQ13421 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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