Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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ITGB3BPQ13352 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGB3BPQ13352 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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ITGB3BPQ13352 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ITGB3BPQ13352 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ITGB3BPQ13352 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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