Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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