Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms