Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRERF1Q96PN7 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRERF1Q96PN7 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRERF1Q96PN7 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRERF1Q96PN7 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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TRERF1Q96PN7 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TRERF1Q96PN7 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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