Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHCHD4Q8N4Q1 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms