Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SSX1Q16384 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms