Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
C1orf61Q13536 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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