Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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TUBB3Q13509 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TUBB3Q13509 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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