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| FOXE3 | Q13461 | AC009276.1-201 | ENST00000422042 | 253 nt | TSL 5 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HNRNPA3P4-201 | ENST00000427514 | 803 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NRBF2P3-201 | ENST00000432731 | 865 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC010132.1-201 | ENST00000433315 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC069061.3-201 | ENST00000582254 | 823 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | MUC2-202 | ENST00000613187 | 4845 nt | BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TBC1D23-201 | ENST00000344949 | 3656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KIAA1456-203 | ENST00000524591 | 9587 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR10G4-203 | ENST00000641722 | 3301 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | WDR5B-201 | ENST00000330689 | 3720 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZBTB8A-202 | ENST00000373510 | 7075 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLITRK4-202 | ENST00000356928 | 3074 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF850-203 | ENST00000614887 | 7625 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.18 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLCO1A2-201 | ENST00000307378 | 7682 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC008691.1-207 | ENST00000636819 | 4154 nt | TSL 5 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C2orf73-202 | ENST00000398634 | 1921 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC00507-201 | ENST00000540882 | 1935 nt | TSL 5 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL034549.2-201 | ENST00000618285 | 3373 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF560-201 | ENST00000301480 | 2654 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC02384-201 | ENST00000360485 | 471 nt | TSL 5 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Y_RNA.153-201 | ENST00000363615 | 91 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC096558.2-201 | ENST00000546678 | 506 nt | TSL 3 BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC005357.1-201 | ENST00000588399 | 301 nt | BASIC | 4.17 | □□□□□ -1.74 | | |