Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms