Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATMQ13315 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
ATMQ13315 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
ATMQ13315 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
ATMQ13315 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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