Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRDNQ13061 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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