Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms