Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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