Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRBP23467 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
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PTPRBP23467 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
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PTPRBP23467 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
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PTPRBP23467 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRBP23467 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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PTPRBP23467 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRBP23467 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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