Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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