Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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SSX1Q16384 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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