Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAMA4Q16363 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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