Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CCDC6Q16204 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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