Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCINQ13939 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCINQ13939 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.5 ms