Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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