Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ITGA9Q13797 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms