Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
ATRQ13535 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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