Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
SF3B2Q13435 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SF3B2Q13435 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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