Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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