Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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TRDNQ13061 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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TRDNQ13061 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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TRDNQ13061 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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TRDNQ13061 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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TRDNQ13061 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRDNQ13061 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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