Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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