Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD3Q12873 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHD3Q12873 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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