Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CENPEQ02224 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms