Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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SH3BP1Q9Y3L3 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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SH3BP1Q9Y3L3 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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SH3BP1Q9Y3L3 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
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SH3BP1Q9Y3L3 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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SH3BP1Q9Y3L3 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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