Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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RNF20Q5VTR2 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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