Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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RTL8BQ17RB0 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RTL8BQ17RB0 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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