Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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CDKN3Q16667 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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