Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ZNF239Q16600 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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