Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNCBQ16143 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SNCBQ16143 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SNCBQ16143 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.59□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SNCBQ16143 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SNCBQ16143 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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