Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms