Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTGDRQ13258 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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PTGDRQ13258 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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