Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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CBX3Q13185 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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