Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GPS1Q13098 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms