Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRAF1Q13077 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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