Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GRIK3Q13003 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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GRIK3Q13003 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GRIK3Q13003 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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