Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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