Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRERF1Q96PN7 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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