Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CHCHD4Q8N4Q1 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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CHCHD4Q8N4Q1 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CHCHD4Q8N4Q1 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CHCHD4Q8N4Q1 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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CHCHD4Q8N4Q1 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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