Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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TRAF7Q6Q0C0 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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TRAF7Q6Q0C0 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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TRAF7Q6Q0C0 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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TRAF7Q6Q0C0 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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TRAF7Q6Q0C0 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TRAF7Q6Q0C0 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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