Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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RTL8BQ17RB0 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RTL8BQ17RB0 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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