Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms