Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
ITGB3BPQ13352 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
ITGB3BPQ13352 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms