Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ACACAQ13085 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms